Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx1-2P42580 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms