Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf9P41274 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms