Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Chd1P40201 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chd1P40201 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd1P40201 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chd1P40201 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chd1P40201 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chd1P40201 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chd1P40201 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms