Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik2P39087 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik2P39087 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grik2P39087 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik2P39087 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik2P39087 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grik2P39087 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms