Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk2P38575 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms