Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptpn1P35821 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms