Protein–RNA interactions for Protein: P35803

Gpm6b, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpm6bP35803 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpm6bP35803 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpm6bP35803 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms