Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ddit3P35639 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms