Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin1P35438 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin1P35438 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin1P35438 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms