Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Grin2aP35436 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms