Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PpardP35396 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpardP35396 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpardP35396 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpardP35396 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpardP35396 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpardP35396 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpardP35396 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpardP35396 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpardP35396 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpardP35396 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PpardP35396 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PpardP35396 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PpardP35396 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PpardP35396 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PpardP35396 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PpardP35396 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PpardP35396 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PpardP35396 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PpardP35396 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PpardP35396 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpardP35396 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpardP35396 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PpardP35396 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpardP35396 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpardP35396 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpardP35396 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpardP35396 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpardP35396 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpardP35396 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpardP35396 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpardP35396 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PpardP35396 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PpardP35396 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PpardP35396 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PpardP35396 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpardP35396 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms