Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab20P35295 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab20P35295 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab20P35295 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Rab20P35295 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab20P35295 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab20P35295 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab20P35295 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab20P35295 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms