Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab21P35282 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab21P35282 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab21P35282 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab21P35282 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab21P35282 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab21P35282 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab21P35282 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab21P35282 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms