Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab6aP35279 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab6aP35279 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms