Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab5cP35278 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5cP35278 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab5cP35278 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms