Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2aP34056 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2aP34056 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2aP34056 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2aP34056 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2aP34056 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2aP34056 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2aP34056 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2aP34056 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2aP34056 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2aP34056 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2aP34056 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2aP34056 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2aP34056 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2aP34056 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2aP34056 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2aP34056 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms