Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SsbP32067 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SsbP32067 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SsbP32067 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SsbP32067 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SsbP32067 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SsbP32067 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SsbP32067 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SsbP32067 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SsbP32067 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SsbP32067 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SsbP32067 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SsbP32067 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SsbP32067 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SsbP32067 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SsbP32067 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SsbP32067 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SsbP32067 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SsbP32067 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SsbP32067 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SsbP32067 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SsbP32067 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SsbP32067 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SsbP32067 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SsbP32067 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SsbP32067 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SsbP32067 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SsbP32067 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SsbP32067 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SsbP32067 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SsbP32067 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SsbP32067 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SsbP32067 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SsbP32067 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SsbP32067 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SsbP32067 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SsbP32067 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SsbP32067 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SsbP32067 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SsbP32067 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SsbP32067 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SsbP32067 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SsbP32067 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SsbP32067 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SsbP32067 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SsbP32067 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SsbP32067 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SsbP32067 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SsbP32067 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SsbP32067 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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