Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc10P31257 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms