Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx2P30658 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx2P30658 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx2P30658 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx2P30658 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cbx2P30658 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cbx2P30658 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx2P30658 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms