Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd3P30282 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd3P30282 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd3P30282 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd3P30282 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd3P30282 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd3P30282 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd3P30282 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnd3P30282 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnd3P30282 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnd3P30282 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccnd3P30282 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd3P30282 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd3P30282 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd3P30282 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd3P30282 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd3P30282 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd3P30282 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd3P30282 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd3P30282 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms