Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HexaP29416 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HexaP29416 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HexaP29416 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HexaP29416 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HexaP29416 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HexaP29416 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HexaP29416 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HexaP29416 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HexaP29416 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HexaP29416 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HexaP29416 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HexaP29416 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HexaP29416 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HexaP29416 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HexaP29416 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HexaP29416 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HexaP29416 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HexaP29416 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HexaP29416 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HexaP29416 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HexaP29416 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HexaP29416 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HexaP29416 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HexaP29416 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HexaP29416 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HexaP29416 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HexaP29416 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HexaP29416 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HexaP29416 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HexaP29416 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HexaP29416 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HexaP29416 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HexaP29416 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HexaP29416 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HexaP29416 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HexaP29416 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HexaP29416 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HexaP29416 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HexaP29416 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HexaP29416 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HexaP29416 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HexaP29416 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HexaP29416 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HexaP29416 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HexaP29416 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HexaP29416 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HexaP29416 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HexaP29416 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HexaP29416 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HexaP29416 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HexaP29416 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HexaP29416 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HexaP29416 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HexaP29416 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HexaP29416 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HexaP29416 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HexaP29416 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HexaP29416 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HexaP29416 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HexaP29416 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms