Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxraP28700 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxraP28700 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxraP28700 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxraP28700 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxraP28700 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxraP28700 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxraP28700 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxraP28700 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxraP28700 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxraP28700 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxraP28700 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxraP28700 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxraP28700 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxraP28700 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxraP28700 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxraP28700 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxraP28700 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxraP28700 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxraP28700 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxraP28700 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxraP28700 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxraP28700 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxraP28700 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxraP28700 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxraP28700 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxraP28700 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxraP28700 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxraP28700 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxraP28700 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxraP28700 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxraP28700 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxraP28700 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxraP28700 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxraP28700 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxraP28700 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxraP28700 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxraP28700 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxraP28700 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxraP28700 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RxraP28700 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RxraP28700 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RxraP28700 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxraP28700 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxraP28700 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxraP28700 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxraP28700 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxraP28700 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxraP28700 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxraP28700 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxraP28700 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxraP28700 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxraP28700 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxraP28700 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxraP28700 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RxraP28700 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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