Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapbP28663 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapbP28663 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NapbP28663 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapbP28663 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapbP28663 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapbP28663 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapbP28663 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapbP28663 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NapbP28663 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapbP28663 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapbP28663 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapbP28663 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapbP28663 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapbP28663 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapbP28663 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapbP28663 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapbP28663 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapbP28663 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapbP28663 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapbP28663 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapbP28663 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NapbP28663 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapbP28663 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NapbP28663 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapbP28663 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapbP28663 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapbP28663 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapbP28663 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapbP28663 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NapbP28663 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NapbP28663 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NapbP28663 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NapbP28663 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapbP28663 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapbP28663 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapbP28663 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapbP28663 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapbP28663 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapbP28663 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapbP28663 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NapbP28663 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapbP28663 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapbP28663 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapbP28663 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapbP28663 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapbP28663 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapbP28663 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapbP28663 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapbP28663 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapbP28663 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapbP28663 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapbP28663 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapbP28663 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapbP28663 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapbP28663 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NapbP28663 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NapbP28663 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NapbP28663 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NapbP28663 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NapbP28663 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NapbP28663 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NapbP28663 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NapbP28663 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NapbP28663 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NapbP28663 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NapbP28663 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NapbP28663 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NapbP28663 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NapbP28663 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NapbP28663 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NapbP28663 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NapbP28663 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NapbP28663 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NapbP28663 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NapbP28663 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NapbP28663 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NapbP28663 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NapbP28663 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NapbP28663 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NapbP28663 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NapbP28663 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NapbP28663 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NapbP28663 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NapbP28663 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NapbP28663 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NapbP28663 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NapbP28663 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NapbP28663 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NapbP28663 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NapbP28663 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NapbP28663 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NapbP28663 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NapbP28663 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NapbP28663 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NapbP28663 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NapbP28663 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NapbP28663 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NapbP28663 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NapbP28663 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms