Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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Hoxd10P28359 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd10P28359 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Hoxd10P28359 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Hoxd10P28359 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Hoxd10P28359 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Hoxd10P28359 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Hoxd10P28359 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Hoxd10P28359 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Hoxd10P28359 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Hoxd10P28359 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Hoxd10P28359 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Hoxd10P28359 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Hoxd10P28359 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Hoxd10P28359 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd10P28359 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10P28359 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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