Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LoxP28301 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LoxP28301 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LoxP28301 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LoxP28301 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LoxP28301 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LoxP28301 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LoxP28301 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LoxP28301 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LoxP28301 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LoxP28301 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LoxP28301 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LoxP28301 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LoxP28301 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LoxP28301 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LoxP28301 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LoxP28301 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LoxP28301 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LoxP28301 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LoxP28301 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LoxP28301 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LoxP28301 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LoxP28301 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LoxP28301 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LoxP28301 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LoxP28301 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LoxP28301 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LoxP28301 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LoxP28301 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LoxP28301 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LoxP28301 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LoxP28301 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LoxP28301 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LoxP28301 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LoxP28301 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LoxP28301 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LoxP28301 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LoxP28301 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LoxP28301 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LoxP28301 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LoxP28301 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LoxP28301 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LoxP28301 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LoxP28301 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LoxP28301 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LoxP28301 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LoxP28301 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LoxP28301 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LoxP28301 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LoxP28301 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LoxP28301 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LoxP28301 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LoxP28301 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LoxP28301 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LoxP28301 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LoxP28301 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LoxP28301 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LoxP28301 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LoxP28301 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LoxP28301 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LoxP28301 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms