Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vav1P27870 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vav1P27870 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vav1P27870 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vav1P27870 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vav1P27870 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vav1P27870 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms