Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpbP27790 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CenpbP27790 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpbP27790 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpbP27790 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpbP27790 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms