Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl3P27659 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms