Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af2P26369 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af2P26369 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af2P26369 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af2P26369 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms