Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnd1P25322 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms