Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col8a2P25318 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col8a2P25318 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms