Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkchP23298 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkchP23298 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkchP23298 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PrkchP23298 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkchP23298 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms