Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PparaP23204 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PparaP23204 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PparaP23204 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PparaP23204 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PparaP23204 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PparaP23204 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PparaP23204 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PparaP23204 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PparaP23204 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PparaP23204 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PparaP23204 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PparaP23204 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PparaP23204 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PparaP23204 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PparaP23204 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PparaP23204 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PparaP23204 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PparaP23204 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PparaP23204 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PparaP23204 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PparaP23204 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PparaP23204 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PparaP23204 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PparaP23204 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PparaP23204 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PparaP23204 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PparaP23204 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PparaP23204 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PparaP23204 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PparaP23204 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PparaP23204 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PparaP23204 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PparaP23204 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PparaP23204 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PparaP23204 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PparaP23204 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PparaP23204 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PparaP23204 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PparaP23204 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PparaP23204 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PparaP23204 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PparaP23204 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PparaP23204 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PparaP23204 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PparaP23204 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PparaP23204 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PparaP23204 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PparaP23204 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PparaP23204 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PparaP23204 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PparaP23204 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PparaP23204 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PparaP23204 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PparaP23204 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PparaP23204 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PparaP23204 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms