Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd3eP22646 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms