Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tap1P21958 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tap1P21958 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tap1P21958 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tap1P21958 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tap1P21958 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tap1P21958 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tap1P21958 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tap1P21958 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms