Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpcP21841 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpcP21841 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpcP21841 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpcP21841 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpcP21841 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpcP21841 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpcP21841 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpcP21841 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpcP21841 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpcP21841 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpcP21841 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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