Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms