Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ms4a2P20490 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms