Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms