Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpraP18052 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpraP18052 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpraP18052 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpraP18052 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpraP18052 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtpraP18052 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms