Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Selenbp1P17563 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms