Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa-rs1P17533 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Defa-rs1P17533 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa-rs1P17533 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa-rs1P17533 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa-rs1P17533 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa-rs1P17533 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa-rs1P17533 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa-rs1P17533 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa-rs1P17533 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms