Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms