Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmnb1P14733 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmnb1P14733 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lmnb1P14733 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms