Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms