Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn1P12960 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms