Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtcP11725 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtcP11725 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtcP11725 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtcP11725 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtcP11725 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtcP11725 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtcP11725 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtcP11725 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtcP11725 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtcP11725 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OtcP11725 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtcP11725 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtcP11725 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtcP11725 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
OtcP11725 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
OtcP11725 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtcP11725 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtcP11725 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtcP11725 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtcP11725 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtcP11725 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtcP11725 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtcP11725 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtcP11725 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtcP11725 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtcP11725 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtcP11725 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtcP11725 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtcP11725 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtcP11725 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtcP11725 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms