Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga5P11688 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga5P11688 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga5P11688 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga5P11688 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms