Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms