Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fv4P11370 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fv4P11370 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fv4P11370 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fv4P11370 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fv4P11370 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fv4P11370 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms